Molecular characterization of Cordyline virus 1 isolates infecting yam (Dioscorea spp)
Diouf, Mame Boucar | Gaspard, Olyvia | Marais, Armelle | Filloux, Denis | Gomez, Rose-Marie | Faure, Chantal | Roumagnac, Philippe | Candresse, Thierry | Theil, Sébastien | Contreras, Sandy | Teycheney, Pierre-Yves | Umber, Marie | Agrosystèmes tropicaux (ASTRO) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | Biologie du fruit et pathologie (BFP) ; Université de Bordeaux (UB)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Plant Health Institute of Montpellier (UMR PHIM) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | This work was funded by the Agence Nationale de la Recherche (ANR) and the Guadeloupe Region through the NetBiome program under project SafePGR (ANR-11-EBIM-0002) and by the European Commission and the Guadeloupe Region through the Malin project (2018-FED-1088) under the EU's Seventh Framework Programme. | ANR-11-EBIM-0002,SafePGR,Amélioration du diagnostic viral pour sécuriser les ressources génétiques végétales(2011)
The nucleotide sequences reported in this work have been deposited in the GenBank database under accession numbers MZ648045 to MZ648087 and OM471839.
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Показать больше [+] Меньше [-]Английский. Cordyline virus 1 (CoV1) is a velarivirus that has so far only been reported in ornamental Ti plants (Cordyline fruticosa). Using high-throughput sequencing, we identified CoV1 infection in yam accessions from Vanuatu. Using a specific RT-PCR assay, we found that CoV1 is also present and highly prevalent in Dioscorea alata, D. cayenensis, and D. trifida in Guadeloupe. Phylogenetic analysis showed that CoV1 isolates infecting yam in Guadeloupe display a low level of molecular diversity. These data provide insights into the transmission of CoV1 in yam in Guadeloupe.
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Библиографическая информация
Эту запись предоставил Institut national de la recherche agronomique