Estimación de la heredabilidad usando información de pedigree y genómica en caracteres de composición de carcasa y calidad de carne

La información de un panel de marcadores moleculares, condicional o no en la información del pedigree, permite estimar la proporción realizada del genoma compartido idéntico por descendencia (IBD) entre un par de individuos. Dicha medida ha demostrado refinar los parentescos y aumentar la exactitud de la predicción de los valores de cría, respecto del modelo tradicional de pedigree.Asimismo, los parentescos genómicos pueden reemplazar los de pedigree en la estimación de la heredabilidad (h2) y los componentes de varianza genética. Sin embargo, en poblaciones reales no hay antecedentes suficientes que aseguren que el parecido genómico, estimado con algoritmos IBD, logre mayor (h2) y/o mayor habilidad predictiva (r y y ). El objetivo de este trabajo fue evaluar el impacto de usar diferentes matrices de parentesco, que ponderen diferencialmente la información del pedigree y genómica, ajustando un modelo lineal mixto, en la estimación de los componentes de varianza y h2 para caracteres de composición de carcasa y calidad de la carne, medidos en una población experimental de cerdos. Los modelos comparados fueron: BLUP convencional (A 22); GBLUP con relaciones genómicas basadas en los enfoques de identidad por estado (IBS) (G ibs) y de IBD (G ibd). El desempeño de los modelos se evaluó mediante validación cruzada. Las estimaciones de la varianza aditiva y h2 fueron ligeramente mayores con el modelo G ibd que con el modelo G ibs para la mayoría de los caracteres, aunque las diferencias no tuvieron significancia estadística. Los modelos genómicos tuvieron mejor r y y que el modelo convencional de pedigree. La r y y fue mayor con el modelo G ibs que el modelo G ibd, sugiriendo que la matriz G ibs recuperaría mayor variabilidad en las relaciones de parentesco. Nuestros resultados revelaron que el uso de estimaciones más precisas del parentesco genómico, como las de algoritmos basados en IBD, no se traducen necesariamente en estimaciones más precisa de h 2 y/o de la r y y.

Maestría en Biometría y Mejoramiento

49 p. : tbls., grafs.