Draft genome sequence data of Nothopassalora personata, peanut foliar pathogen from Argentina
2024
Monguillot, Joaquín Humberto | Arias, Renee S. | Orner, Valerie A. | Massa, Alicia N. | Sobolev, Victor S. | Bernanrdi Lima, Nelson | Paredes, Juan Andrés | Oddino, Claudio | Carmona, Marcelo | Conforto, Erica Cinthia
Late leaf spot (LLS) caused by the Ascomycete Nothopassalora personata (N.p.) (Syn. Cercosporidium personatum) is the main foliar disease of peanuts in Argentina and in peanut producing areas of the world, causing up to 70% yield losses. The extremely slow growth of this fungus in culture, that takes around one month to form a 1 cm colony (0.45 mm/day), and the lack of adequate young tissues from where to extract nucleic acids, have hindered genetic studies of this pathogen. Here, we report the first genome sequence of a N. personata isolate from South America, as well as genetic variants on its conserved genes, and the complete sequence of its mating-type locus MAT1-2 idiomorph. The N. personata isolate IPAVE 0302 was obtained from peanut leaves in Córdoba, Argentina. The whole genome sequencing of IPAVE 0302 was performed as paired end 150 bp NovaSeq 6000 and de novo assembled. Clean reads were mapped to the reference genome for this species NRRL 64463 and the genetic variants on highly conserved genes and throughout the genome were analyzed. Sequencing data were submitted to NCBI GenBank Bioproject PRJNA948451, accession number SRR23957761. Additional Fasta files are available from Harvard Dataverse
Показать больше [+] Меньше [-]Instituto de Patología Vegetal
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Monguillot, Joaquín Humberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Monguillot, Joaquín Humberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Arias, Renee S. United States Department of Agriculture (USDA). Agricultural Research Service (ARS). National Peanut Research Laboratory (NPRL); Estados Unidos
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Orner, Valerie A. United States Department of Agriculture (USDA). Agricultural Research Service (ARS). National Peanut Research Laboratory (NPRL); Estados Unidos
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Massa, Alicia N. United States Department of Agriculture (USDA). Agricultural Research Service (ARS). National Peanut Research Laboratory (NPRL); Estados Unidos
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Sobolev, Victor S. United States Department of Agriculture (USDA). Agricultural Research Service (ARS). National Peanut Research Laboratory (NPRL); Estados Unidos
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Bernanrdi Lima, Nelson. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Bernanrdi Lima, Nelson. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Paredes, Juan Andrés. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Paredes, Juan Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Oddino, Claudio M. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología (IMICO); Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Carmona, Marcelo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Catedra de Fitopatología; Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Conforto, Erica Cinthia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Fil: Conforto, Erica Cinthia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentina
Показать больше [+] Меньше [-]Ключевые слова АГРОВОК
Библиографическая информация
Эту запись предоставил Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria