Assessment of Genetic Diversity in Safflower (Carthamus tinctorius L.) Using RAPD Markers | Aspir (Carthamus tinctorius L.) 'de Genetik Çeşitliliğin RAPD Markörleri Kullanarak Değerlendirilmesi

This research was carried out to determine thegenetic distances and variability between some safflower landraces andregistered varieties. As plant material, four safflower landraces (TR 49119, TR42630, TR 42670 and TR 64702) and three registered varieties (Yenice 5-38,Remzibey 05 and Dinçer 5-118) obtained from the Aegean Agricultural ResearchInstitute, Turkey were used. The safflower varieties were analyzed at themolecular level using RAPD markers. The polymorphic band ratios of ten RAPDprimers varied from 33.3% to (OPK-11) 80% (OPS-04). The average polymorphic bandratio was found to be 63.9%. The polymorphism information content values of theRAPD primers ranged from 0.24 for OPC-03 to 0.46 for OPA-19. The mean PIC valuewas determined as 0.38. The mean resolution power value was found to be 3.37,the effective multiplex ratio value was 4.14, and the marker index value was1.57. The genetic distances were obtained using NTSYS-pc 2.20j statisticpackage program according to Jaccard’s similarity coefficient. The geneticsimilarity values of the safflower genotypes varied between 0.61 and 0.85. Theaverage similarity was calculated as 0.69. The cluster analyses of the RAPDmarkers grouped the genotypes into two major clusters (UPGMA dendrogram). Withslight differences, the landraces and registered varieties were included inseparate groups. The TR 64702 line and Remzibey 05 registered variety weregenetically most similar genotypes with a value of 0.85.

Çalışmada, Ege Tarımsal Araştırma EnstitüsüMüdürlüğü’nden temin edilmiş olan 4 yerel çeşit (TR 49119, TR 42630, TR 42670ve TR 64702) ve üç adet tescilli aspir çeşidi (Yenice 5-38, Remzibey 05 veDinçer 5-118) materyal olarak kullanılmıştır. Aspir çeşitleri, RAPD markörlerikullanılarak moleküler düzeyde analiz edilmiştir. Kullanılan on adet RAPDprimerinin polimorfik bant oranı % 33.3 (OPK-11) ile % 80 (OPS-04) arasındadeğişim göstermiştir. Ortalama polimorfik bant oranı % 63.9 olarakbelirlenmiştir. RAPD primerlerinin polimorfik bilgi içeriği (PIC) değerleriincelendiğinde, 0.24 (OPC-03) ile 0.46 (OPA-19) arasında değişim gösterdiğigözlenmiştir. Ortalama PIC değeri 0.38 olarak bulunmuştur. Ortalama çözümlemegücü değeri 3.37, etkili multipleks oran değeri 4.14 ve markör endeks değeriise 1.57 olarak belirlenmiştir. NTSYS-pc 2.20j istatistik paket programındaJaccard’ın benzerlik katsayısına göre genotipler arasındaki genetik uzaklıkdeğerleri elde edilmiştir. Aspir genotiplerine ait genetik benzerlik değerleri0.61 ile 0.85 arasında değişim göstermiştir. Ortalama benzerlik oranı 0.69olarak bulunmuştur. Aspir çeşitleri UPGMA gruplandırmasınagöre iki gruba ayrılmışlardır. Küçük bir nüansla yerli ve tescilli çeşitlerayrı gruplarda yer almıştır. TR 64702 yerel çeşidi ile Remzibey 05 tescilliçeşidi 0.85 değeriyle genetik olarak en benzer genotipler olarak gözlenmiştir.