Pathological, molecular and phylogenic study of fowlpox virus in domesticated chickens of Tikrit City, Iraq | Estudo patológico, molecular e filogenético do vírus da varíola aviária em frangos de corte domesticados da cidade de Tikrit, Iraque

португальский. O vírus da varíola aviária (VVA) é um dos vírus que acometem os frangos de corte em todo o mundo, causando perdas patológicas e econômicas na indústria aviária. As lesões causadas pelo vírus são facilmente reconhecidas pela observação visual e usualmente aparecem nas áreas do corpo das aves livres de penas, especialmente na cabeça. Além disso, em alguns casos a doença pode provocar a cegueira e a mortalidade de animais acometidos. O presente trabalho foi delineado para diagnosticar casos suspeitos de varíola aviária, identificar o agente causal e classificá-lo. Adicionalmente foram analisadas diferenças e similaridades com outros vírus estreitamente relacionados em localidades vizinhas e regionais. Cinquenta amostras foram colhidas em três localidades da cidade de Tikrit de frangos de corte, domesticados, que apresentavam lesões cutâneas. O DNA do vírus foi extraído diretamente das amostras de tecidos antes que a técnica de PCR fosse realizada. As proteínas do core do vírus, gene (P4b), foram parcialmente sequenciadas de analisadas em secções da rotina histológica. Os resultados obtidos revelaram que o vírus causa lesões variólicas com hiperplasia dermal e hiperqueratose. A hiperplasia e a congestão da membrana corioalantóica também foram registradas. O estudo também revelou que o DNA do VVA pode ser extraído diretamente de tecidos animais sem a realização de uma pré-purificação. A análise sequencial revelou que o VVA foi confirmado em todas as amostras agrupando-se em uma classe A, idêntica com isolados iranianos e egípcios. A conclusão obtida foi que o presente trabalho confirmou que o vírus pertence ao tipo dérmico clássico dos poxvirus e que as curtas distâncias genéticas entre os vírus relacionados são encontradas em países vizinhos. Também foi concluído que o gene conservador P4b inclui pontos de mutação que o tornam um gene prático para diagnosticar o vírus em análises filogenéticas.

Английский. Fowlpox virus (FPV) is one of the viruses affecting chickens worldwide, causing pathological and economic losses in the poultry industry. Viral lesions are easily recognizable by the eye and usually appear in the featherless areas, especially the head. Moreover, the virus could lead to blindness and mortality in some cases. This study diagnosed the suspected fowlpox cases, identified and classified the causative agent. We also analyzed the differences and similarities of closely related viruses at the neighboring and regional countries. Fifty samples were collected from three locations of Tikrit city from the domesticated chickens, which showed cutaneous lesions. Virus DNA was extracted directly from tissue samples before the nested PCR technique was performed. The virion core protein (P4b) gene is partially sequenced and analyzed with routine histological sectioning. Results showed that the virus causes pock lesions of dermal hyperplasia and hyperkeratosis. Hyperplasia and congestion of the chorioallantoic membrane were also recorded. The study also showed that the DNA of FPV could be extracted directly from animal tissue without further purification. The sequence analysis showed that the FPV was confirmed in all samples clustered in clade A identical with Iranian and Egyptian isolates. In conclusion, this study approved that the virus belongs to the classical dermal type of poxviruses and the short genetic distances between viruses related to closely neighboring countries. We also concluded that the conservative P4b gene included mutation sites that make this gene practical for diagnosing the virus and phylogenetic analysis.