Intrabreed variability of Landrace animals based on microsatellite DNA polymorphism | Внутрипородная изменчивость животных породы ландрас на основе полиморфизма ДНКмикросателлитов

Английский. The population genetic parameters of Landrace breed animals bred at SE “ZhodinoAgroPlemElita”, PUE “Polesye-Agroinvest” and agricultural branch of SHC “Zadneprovsky” of OJSC “Orshanskiy KHP” were analyzed using microsatellite DNA data. 110 alleles were identified. The number of alleles for the loci ranged from 3 to 10. The highest level of allelic diversity was found in animals bred at SE “ZhodinoAgroPlemElita” – 5.40 alleles per locus. It was revealed that the population of animals of SHC “Zadneprovsky” was in the equilibrium state, the fixation index was equal to 0.001. Deviations from the equilibrium state were observed in pigs of SE “ZhodinoAgroPlemElita” (Fis = –0,019) and PUE “Polesye-Agroinvest” (Fis = –0,018). The actual degree of heterozygosity in animals ranged from 0.549 (PUE “Polesye-Agroinvest”) to 0.662 (SE “ZhodinoAgroPlemElita”). The results of the Hardy-Weinberg equilibrium test showed that most of the MS DNA loci used were in a state of genetic equilibrium. The polymorphism information content (PIC) value of most of the studied loci exceeded 0.5, indicating their high informativeness as molecular genetic markers. The loci S0005 (Fst = 0.103), SW857 (Fst = 0.103) and SW240 (Fst = 0.202) were found to make the most substantial contribution to intrabreed differentiation of Landrace breed pigs. The results of the Assignment test showed that, in general, the accuracy of assignment of the studied animals to “their own” population exceeded 98 %. A high degree of genetic similarity between the Landrace breed animals of these populations was determined, the coefficients of genetic similarity made 0.795–0.874.

Русский. Проведен анализ популяционно-генетических параметров животных породы ландрас, разводимых в ГП «ЖодиноАгроПлемЭлита», ЧУП «Полесье-Агроинвест» и cельскохозяйственном филиале «СГЦ «Заднепровский» ОАО «Оршанский КХП» на основе ДНК-МС. Выявлено 110 аллелей. Число аллелей для локусов варьировало в пределах от 3 до 10. Наибольший уровень аллельного разнообразия установлен у животных, разводимых в ГП «Жо диноАгроПлемЭлита», – 5,40 аллеля на локус. Выявлено, что популяция животных в СГЦ «Заднепровский» находится в равновесном состоянии, показатель индекса фиксации равен 0,001. Отклонения от равновесного состояния отмечено у свиней в ГП «ЖодиноАгроПлемЭлита» (Fis = –0,019) и ЧУП «Полесье-Агроинвест» (Fis = –0,018). Фактическая степень гетерозиготности у животных варьировала от 0,549 (ЧУП «Полесье-Агроинвест») до 0,662 (ГП «ЖодиноАгроПлемЭлита»). Результаты проверки на равновесие Харди – Вайнберга свидетельствуют, что большая часть использованных локусов ДНК-МС находится в состоянии генетического равновесия. Величина информативной ценности большинства изученных локусов (PIC) > 0,5, что указывает на их высокую информативность в качестве молекулярно-генетических маркеров. Установлено, что наибольший вклад во внутрипородную дифференциацию свиней породы ландрас вносят локусы S0005 (Fst = 0,103), SW857 (Fst = 0,103) и SW240 (Fst = 0,202). Результаты Assignment-теста свидетельствуют, что в целом, по всем исследованным животным, точность отнесения к «своей» популяции превышает 98 %. Установлен высокий уровень генетического сходства животных породы ландрас данных популяций, коэффициенты генетического сходства составили 0,795–0,874.