Estudos filogenéticos e moleculares no gênero Triplophyllum Holttum (Tectariaceae) com ênfase em espécies amazônicas : estrutura do plastoma, evolução de caracteres morfológicos e taxinomia

Orientador: Prof. Dr. Paulo Henrique Labiak Evangelista

Banca: Paulo Henrique Labiak Evangelista (Presidente da Banca), Mateus Arduvino Reck, Fernando Bittencourt de Matos e Jefferson Prado

Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Botânica. Defesa : Curitiba, 18/07/2025

Inclui referências

Resumo: Triplophyllum pertence à familia Tectariaceae e está representado por cerca de 25 espécies distribuídas nas regiões neotropicais, africanas e de Madagascar. No Brasil, o gênero é especialmente diverso no bioma amazônico, onde ocorrem sete espécies. Estudos prévios confirmam a monofilia do gênero, mas a amostragem limitada ainda impede a clara resolução das relações entre as espécies. Neste estudo, apresentamos os genomas completos de Hypoderris e Triplophyllum e os comparamos com outros genomas já disponíveis, representando as principais linhagens de Polypodiales. Reconstruímos a filogenia molecular para Triplophyllum, com base em quatro marcadores plastidiais: o gene rbcL, e os espaçadores intergênicos rps4-trnG, trnG-trnR e trnL-trnF, e realizamos a reconstrução dos caracteres morfológicos para o gênero. Também descrevemos cinco novos táxons neotropicais: Triplophyllum atlanticum, Triplophyllum ctenitoides, Triplophyllum dalyi, Triplophyllum juruenense, e Triplophyllum neblinae, e designamos um neótipo para Triplophyllum funestum. Os genomas plastidiais sequenciados apresentam 157.784 pares de base para Hypoderris brauniana e 152.493 pb para Triplophyllum hirsutum, ambos com 132 genes, além da descrição de um elemento MORFFO (1866 pares de base). A filogenia incluiu sequencias de 70 espécimes e recuperou Triplophyllum como monofilético, com clados neotropicais, africanos e malgaxes, embora algumas relações internas permaneçam com baixa resolução. As principais sinpomorfias para Triplophyllum incluem o rizoma reptante e as nervuras livres. As principais homoplasias incluem as glândulas na lâmina e indúsios, e tricomas entre nervuras

Abstract: Triplophyllum belongs to the family Tectariaceae and is represented by about 25 species distributed in the Neotropical, African, and Madagascar regions. In Brazil, the genus is particularly diverse in the Amazon biome, where seven species occur. Prior studies confirm the monophyly of the genus, but limited sampling still hinders a clear resolution of the relationships among species. In this study, we present the complete genomes of Hypoderris and Triplophyllum and compare them with other genomes already available, representing the main lineages of Polypodiales. We reconstructed the molecular phylogeny for Triplophyllum, based on four plastid markers: the rbcL gene, and the intergenic spacers rps4-trnG, trnGtrnR, and trnL-trnF, and performed the reconstruction of morphological characters for the genus. We also describe five new Neotropical taxa: Triplophyllum atlanticum, Triplophyllum ctenitoides, Triplophyllum dalyi, Triplophyllum juruenense, and Triplophyllum neblinae, and designated a neotype for Triplophyllum funestum. The sequenced plastid genomes show 157,784 base pairs for Hypoderris brauniana and 152,493 bp for Triplophyllum hirsutum, both with 132 genes, in addition to the description of a MORFFO element (1866 base pairs). The phylogeny included sequences from 70 specimens and recovered Triplophyllum as monophyletic, with Neotropical, African, and Malagasy clades, although some internal relationships remain poorly resolved. The main synapomorphies for Triplophyllum include a creeping rhizome and free venation. The main homoplasies include lamina and indusia glands, and hairs among the veins