Potential of microsatellites as a cattle breed marker
2000
Benyamin, B. | Muladno | Noor, R.R. (Institut Pertanian Bogor, Bogor (Indonesia). Fakultas Peternakan)) | Farajalah, A. | Hedah, D.
英语. One of the characteristics of microstellite hypervariable with the number of allele could be more than 18 per locus. Microsatellite alleles could be different from one cattle breed to another. It shows that microsatellite is potential to be used as a cattle breed marker. In order to know the ability of microsatellite as a cattle breed marker, eight primers were used to analyze 4 cattle breeds namely Bali (6 heads), Simmental, Limousin, and Brangus (each breed consists of 3 heads). The primer sequences was based on the information from International Cattle Diversity Projects. DNA samples were isolated from cattle's sperm. The result showed that primer HEL9 could be used to find specific allele in Bali cattle. Furthermore, primer ILST005 could be used to find specific allele in Brangus cattle. Overall, the total number of allele, which is found, was 1-3 with the average of 1.78 for Bali, 1.56 for Simmental and 1.22 for Brangus and Limousin. In order to get more confident and comprehensive results, we suggest to analyze the progeny's allele
显示更多 [+] 显示较少 [-]印度尼西亚. Salah satu karakteristik utama mikrosatelit adalah hypervariable, yang jumlah alelnya dapat mencapai lebih dari 18 buah per lokus. Ini menunjukkan adanya kemungkinan bahwa alel suatu mikrosatelit pada suatu bangsa sapi berbeda dengan alel pada bangsa sapi lainnya. Untuk mengetahui potensi mikrosatelit sebagai penanda bangsa sapi, delapan pasang primer digunakan untuk menganalisis empat bangsa sapi yang terdiri atas sapi Bali (10 ekor), Simmental, Limousin dan Brangus (masing-masing 3 ekor). DNA sekuens delapan primer tersebut diperoleh berdasarkan informasi dari International Cattle Diversity Project dan sampel DNA sapi diisolasi dari sperma. Hasil analisis terbatas pada bangsa sapi yang berbeda di BIB Singosari, Malang, menunjukkan bahwa ada kemungkinan terdapat alel spesifik untuk bangsa sapi Bali dari mikrosatelit HEL9 dan sapi Brangus dari mikrosatelit ILSTS005. Dari seluruh mikrosatelit yang dianalisis, diketahui bahwa jumlah alel berkisar 1 sampai 3 dengan rataan 1,78 pada sapi Bali, 1,56 pada sapi Simmental dan 1,22 pada sapi Brangus dan Limousin. Untuk lebih meyakinkan hasil yang telah diperoleh, perlu dianalisis kestabilan penurunan alel pada keturunannya
显示更多 [+] 显示较少 [-]