Genetic diversity and allelic richness in Spanish wild and domestic pig population estimated from microsatellite markers | Diversidad genética y riqueza alélica en poblaciones españolas de cerdos y jabalíes estimadas a partir de marcadores microsatélite
2008
Silió, L. | Rodrigáñez, J. | Barragán, C. | Alves, E. | Toro, M.A., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal | Gortázar, C.
西班牙语; 卡斯蒂利亚语. Diversas medidas de diversidad genética sustentan las tácticas conservacionistas que procuran mantener la flexibilidad genética de poblaciones animales y razas domésticas. Muchas de estas medidas utilizan marcadores genéticos neutrales y se basan en conceptos clásicos como el parentesco y la heterocigosidad esperada. Como componente de la diversidad genética, la riqueza alélica tiene asimismo importancia en la genética de la conservación. Su medida requiere tener en cuenta las variaciones de tamaño muestral mediante técnicas de rarefacción o extrapolación. En este estudio se han comparado métodos de análisis de diversidad genética y riqueza alélica. Se genotiparon para 18 microsatélites (uno por autosoma) muestras de ADN de 68 jabalíes y 234 cerdos domésticos de las razas Duroc e Ibérico, incluyendo 63 animales de las líneas de cerdo Ibérico Torbiscal y Guadyerbas. Los resultados indican que la ordenación de estas poblaciones de acuerdo a sus contribuciones a la diversidad total se modifica en función de los criterios empleados, ya que diversidad genética y riqueza de alelos privados no contemplan el mismo tipo de diversidad. Asimismo, las técnicas empleadas de rarefacción o extrapolación dan lugar a resultados parcialmente discrepantes. La deseable integración de la riqueza alélica en la teoría de la diversidad genética plantea algunas dificultades no resueltas por el momento.
显示更多 [+] 显示较少 [-]英语. Genetic diversity measures support the conservation decisions aiming to maintain the genetic flexibility of animal populations and breeds. Many of these measures utilize neutral genetic markers and are based on classical concepts as coancestry and expected heterozygosity. As a component of genetic diversity, allelic richness is also important in conservation genetics. Its measurement requires that variations of sample size be taken into account using either the rarefaction and extrapolation techniques. Methods to estimate genetic diversity and allelic richness were compared in this study. DNA samples from 68 wild boars and 234 domestic pigs of the Duroc and Iberian breeds, including 63 animals of the Torbiscal and Guadyerbas Iberian lines, were genotyped for 18 microsatellites (one per autosome). As the results outline, the rank of these pig populations according to their contributions to the diversity will be different depending on the criteria utilized, because genetic diversity and private allelic richness do not exactly address the same type of diversity. Rarefaction and extrapolation-based techniques also produce partially discrepant results. The desirable integration of allelic richness into the diversity theory poses at the moment some unsolved difficulties.
显示更多 [+] 显示较少 [-]