Une nouvelle vision de l’histoire de vie des agents phytopathogènes
2012
Monteil , Caroline (INRA , Montfavet (France). UR 0407 Pathologie Végétale) | Berge , Odile (INRA , Montfavet (France). UR 0407 Pathologie Végétale) | Guilbaud , Caroline (INRA , Montfavet (France). UR 0407 Pathologie Végétale) | Chandeysson , Charlotte (INRA , Montfavet (France). UR 0407 Pathologie Végétale) | Morris , Cindy (INRA , Montfavet (France). UR 0407 Pathologie Végétale)
Aujourd’hui, la recherche sur les microorganismes phytopathogènes est concentrée sur les espaces cultivés. Dans une démarche plus globale et interdisciplinaire, notre équipe étudie ces organismes à plus large échelle, en tenant compte des espaces naturels (1). Un de nos résultats fondateurs est la mise en évidence de populations de la bactérie Pseudomonas syringae, dans des compartiments inexplorés : neige, pluie, eau et biofilms (2) des torrents, plantes sauvages, litière végétale (3), manteau neigeux, dans des zones non cultivées. En aval P. syringae est également isolée des réseaux d’irrigation et des nappes souterraines. Ces observations conduisent à proposer une histoire de vie qui suit le cycle de l’eau douce (4), y compris dans les nuages et les précipitations (5), ce cycle constituant un vecteur puissant d’échange entre les zones cultivées et les espaces naturels. L’exploration de la structure des populations montre de fortes variations selon les génotypes (6) et soulève des hypothèses sur leur dispersion. Nos données récentes démontrent notamment, la survie et le transport de P. syringae dans le sol et suggèrent des flux à travers des matrices solides complexes (sol, sable, alluvions) permettant d’envisager un modèle de transfert. Connaitre ces habitats, les flux de populations entre compartiments et la diversité des microorganismes phytopathogènes, c’est anticiper les épidémies, trouver des moyens de lutte basés sur l’écologie et comprendre le rôle plus large de ces organismes dans les écosystèmes. Des études en cours sur d’autres organismes associés aux plantes avec d’autres histoires de vie montrent la pertinence d’élargir le champ d’investigation de la phytopathologie.
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