Analyse généalogique des races bovines laitières françaises

Cet article présente un bilan de la variabilité génétique dans les huit principales races bovines laitières françaises établi à partir de l’information généalogique. La stratégie d’ouverture diffère entre populations, les races Normande et Tarentaise étant fermées, les races Prim’Holstein, Pie Rouge des Plaines, Brune et Simmental Française faisant largement appel à des gènes extérieurs, tandis que les races Montbéliarde et Abondance ont procédé à une légère infusion de gènes Holstein rouge. Lorsque la qualité des généalogies et la structure de la population permet de le calculer correctement, le niveau de consanguinité est faible mais il s’accroît assez rapidement, de l’ordre de 1 % par génération, ce qui correspond à un effectif génétique réalisé de quelques dizaines de reproducteurs. Le nombre d’ancêtres efficace, dérivé des probabilités d’origine de gènes, est compris entre 17 et 64 et n’est pas corrélé avec le nombre de femelles dans la population. Les races bovines laitières, du fait de l’efficacité de l’insémination artificielle, sont donc des populations extrêmement réduites en terme d’origines génétiques. Des études plus approfondies devront rapidement proposer des solutions visant à préserver la variabilité génétique, mais restant compatibles avec les programmes de sélection actuels. Sans préjuger des réponses à apporter, il semble cependant nécessaire, d’une part, de maintenir toutes les populations existantes et, d’autre part, d’augmenter le nombre de pères à taureaux.

This paper presents an overview of the genetic variability of the 8 main French dairy cattle breeds, estimated through pedigree information. The Normande and Tarentaise breeds are closed populations, the Montbeliarde and Abondance breeds recently introduced a limited amount of Red Holstein genes, whereas the Holstein, Brown Swiss, Pie Rouge des Plaines, and Simmental populations widely use foreign germplasm, sometimes until complete absorption. The estimation of inbreeding is strongly dependent on the population structure and on the quality of the pedigree information. When inbreeding can be correctly estimated, its level is found to increase by about 1 % per generation, and the realized effective size is close to or less than 50. The effective number of ancestors, derived from the probabilities of gene origins, varies from 17 to 64 according to the breed and is not related to the number of females in the population. Due to the efficiency of artificial insemination, the dairy cattle breeds are genetically small populations. Further investigations are needed to propose selection methods more favorable to the preservation of genetic diversity but still compatible with the selection programs. Two urgent proposals are to maintain all existing populations and to increase the number of bull sires in the breeds with the largest number of females.