Potential gain from including major gene information in breeding value estimation

Le but de l’étude est de comparer l’application de deux indices dans le cas d’une sélection sur un caractère quantitatif soumis à l’effet d’un gène majeur. Dans le premier cas, l’indice ne prend pas en compte l’information sur le génotype au locus majeur (méthode standard) alors que le deuxième indice prend en compte cette information (méthode modifiée). Deux types de schémas sont considérés : sélection individuelle et sélection sur descendance. Le calcul du progrès génétique et de l’évolution des fréquences alléliques est réalisé pas à pas en considérant des générations chevauchantes. Tous les effets étudiés sur la supériorité de la méthode modifiée sur la méthode standard suggèrent de nombreuses interactions. Cependant, il ressort que la prise en compte de l’information sur le gène majeur dans l’indexation est avantageuse dans les cas de faible héritabilité, de fort effet du gène majeur et de faible proportion initiale de l’allèle favorable surtout lorsque cet allèle est récessif. Le taux de sélection n’a que peu d’influence sur les résultats. Enfin, l’intérêt de la méthode modifiée est plus visible et plus rapide dans la sélection individuelle que dans la sélection sur descendance. Il n’en demeure pas moins qu’en dehors des conditions extrêmes précédemment citées, l’intérêt de la méthode modifiée sur la méthode standard reste pour le moins limité et la prise en compte de l’information sur les génotypes au locus majeur dans l’indice de sélection, sans modification du schéma de sélection, ne constitue sûrement pas le meilleur outil de valorisation de cette information pour la sélection.

Two indexes were compared for the selection of a quantitative trait in the case of a mixed inheritance. The first index did not consider the major genotype information (standard method) whereas the second index took this information into account (modified method). Two types of selection scheme were considered: individual selection and selection based on a progeny test. The model for the estimation of genetic progress and evolution of allele frequencies takes overlapping generations into account. All of the effects studied suggested a large number of interactions. However, it can be concluded that information about the major gene should be put into the selection indexes when the heritability is low, the major gene effect high and its initial frequency small, in particular for a recessive major gene. The selection pressure has little influence on the results. In the short term, the modified method is of more value in the case of individual selection than in the case of selection based on a progeny test. On the whole, the extra genetic gain of the modified method is limited and considering the major genotypes in the selection indexes without any change of the selection scheme is probably not the best way to use this information.