Spectrométrie de masse et intelligence artificielle pour cartographier le vivant
2023
Hachemi, Hamid | Grenga, Lucia | Armengaud, Jean | Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS) ; Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI) ; Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS) ; Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (LI2D) ; Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI) ; Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS) ; Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS) ; Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Contribution to the journal of the French Chemistry Society "L'actualité chimique" (n°490)
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显示更多 [+] 显示较少 [-]英语. Mass spectrometry (MS) is a highly sensitive technique for analysing organic compounds with a detection limit ofup to femtomole. Recent advances in peptide analysis using tandem mass spectrometry (MS/MS) have made itpossible to establish the identity of tens of thousands of proteins contained in samples as complex as microbiota.However, managing huge quantities of data is a real challenge and an opportunity to be seized. Artificialintelligence (AI) is playing a key role in interpreting spectra and assigning them to peptide sequences. AI is alsorevolutionising the analysis of data on these millions of chemical compounds, leading to the identification ofproteins, the organisms that produced them, and much other functional information. This article describes how avery detailed mapping of the different human microbiota can be obtained, making it possible to identify a verylarge number of proteins contained in samples taken from these microbiota (faeces, saliva, etc.), thus making itpossible to identify the organisms present and their functional profiles using metaproteomics coupled with AI.Biomarkers can thus be identified by exploiting the data, enabling the selection of the most relevant targetsfor therapeutic treatments.
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