A protein coevolution method uncovers critical features of the Hepatitis C Virus fusion mechanism

Douam, Florian | Fusil, Floriane | Enguehard, Margot | Dib, Linda | Nadalin, Francesca | Schwaller, Loïc | Hrebikova, Gabriela | Mancip, Jimmy | Mailly, Laurent | Montserret, Roland | Ding, Qiang | Maisse, Carine | Carlot, Emilie | Xu, Ke | Verhoeyen, Els | Baumert, Thomas F. | Ploss, Alexander | Carbone, Alessandra | François-Loïc, Cosset | Lavillette, Dimitri | Virus enveloppés, vecteurs et immunothérapie – Enveloped viruses, Vectors and Immuno-therapy [CIRI] (CIRI-EVIR) ; Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI) ; École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Princeton University | Infections Virales et Pathologie Comparée - UMR 754 (IVPC) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon | L'Institut hospitalo-universitaire de Strasbourg (IHU Strasbourg) ; Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-l'Institut de Recherche contre les Cancers de l'Appareil Digestif (IRCAD)-La Fédération des Crédits Mutuels Centre Est (FCMCE)-L'Association pour la Recherche contre le Cancer (ARC)-La société Karl STORZ | Department of Ecology and Evolution [UNIL, Lausanne] = Département d'écologie et évolution (DEE) ; Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL) | Biologie Computationnelle, Quantitative et Synthétique [Paris] (ex LCQB) (CQSB) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Mathematical institute ; Universiteit Leiden = Leiden University | Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques (IVH) ; Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | Microbiologie moléculaire et biochimie structurale - Molecular Microbiology and Structural Biochemistry (MMSB) ; Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | CAS Key Laboratory of Molecular Virology and Immunology [Shangai] ; Institut Pasteur de Shanghai, Académie des Sciences de Chine - Chinese Academy of Sciences (IPS-CAS) ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur) | Institut universitaire de France (IUF) ; Ministère de l'Education nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (M.E.N.E.S.R.) | French Agence Nationale de la Recherche sur le Sida et les hepatites virales [ANRS CSS4 AO2014-2q] ; FINOVI foundation ; CAS 100 Talents ; Shanghai municipality 1000 Talents ; National Institutes of Health [R01 AI079031] ; Research Scholar Award from the American Cancer Society [RSG-15-048-01-MPC] ; Burroughs Wellcome Fund Award for Investigators in Pathogenesis ; French Ministry of Research (MESR) ; New Jersey Commission on Cancer Research [DHFS16PPC007] ; Institut Universitaire de France ; Interreg IV-Hepato-Regio-Net | ANR-11-BINF-0003,MAPPING,Vers une cartographie haute résolution des interactions protéiques à l'échelle du génome.(2011) | ANR-11-LABX-0048,ECOFECT,Dynamiques eco-évolutives des maladies infectieuses(2011) | ANR-10-LABX-0028,HepSys,Functional genomics of viral hepatitis and liver disease(2010) | European Project: 305600,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2012-INNOVATION-1,HEPAMAB(2013) | European Project: 233130,EC:FP7:ERC,ERC-2008-AdG,HEPCENT(2009)