Reproductibilité expérimentale en métabolomique
2024
Pujos-Guillot, Estelle | Plateforme Exploration du Métabolisme (PFEM) ; MetaboHUB-Clermont ; MetaboHUB-MetaboHUB-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA) | Unité de Nutrition Humaine (UNH) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA) | Réseau National de la Recherche Reproductible
International audience
显示更多 [+] 显示较少 [-]法语. La métabolomique, dernière-née des sciences omiques, est aujourd’hui un outil de phénotypage puissant en biologie. Elle a démontré sa capacité à fournir des résultats substantiels au sein de diverses communautés en sciences de la vie. Elle a notamment permis de définir avec succès les phénotypes individuels et leurs changements, d’élucider les effets de différents facteurs (par ex. génétique, environnemental, sénescence/vieillissement...), de découvrir des biomarqueurs caractéristiques d’états biologiques particuliers. Cependant, même si les recherches utilisant la métabolomique sont en constante augmentation en santé humaine et biologie végétale/environnementale, son application à très grande échelle est encore limitée en raison de défis technologiques importants à relever, notamment celui de la reproductibilité expérimentale. Nous illustrerons les problématiques de reproductibilité de cette approche, qui est au carrefour de nombreuses disciplines (chimie analytique, biologie, statistiques, bioinformatique…) et ferons un état des lieux des principales avancées et solutions mises en œuvre, mais également les verrous restant à lever.
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