The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance

Tegally, H. | San, J.E. | Cotten, M. | Moir, M. | Tegomoh, B. | Mboowa, G. | Martin, D.P. | Baxter, C. | Lambisia, A.W. | Diallo, A. | Amoako, D.G. | Diagne, M.M. | Sisay, A. | Zekri, AN. | Gueye, A.S. | Sangare, A.K. | Ouedraogo, A.S. | Sow, A. | Musa, A.O. | Sesay, A.K. | Abias, A.G. | Elzagheid, A.I. | Lagare, A. | Kemi, A.S. | Abar, A.E. | Johnson, A.A. | Fowotade, A. | Oluwapelumi, A.O. | Amuri, A.A. | Juru, A. | Kandeil, A. | Mostafa, A. | Rebai, A. | Sayed, A. | Kazeem, A. | Balde, A. | Christoffels, A. | Trotter, A.J. | Campbell, A. | Keita, A.K. | Koné, A. | Bouzid, A. | Souissi, A. | Agweyu, A. | Naguib, A. | Gutierrez, A.V. | Nkeshimana, A. | Page, A.J. | Yadouleton, A. | Vinze, A. | Happi, A.N. | Chouikha, A. | Iranzadeh, A. | Maharaj, A. | Batchi-Bouyou, A.L. | Ismail, A. | Sylverken, A.A. | Goba, A. | Femi, A. | Sijuwola, A.E. | Marycelin, B. | Salako, B.L. | Oderinde, B.S. | Bolajoko, B. | Diarra, B. | Herring, B.L. | Tsofa, B. | Lekana-Douki, B. | Mvula, B. | Njanpop-Lafourcade, B.M. | Marondera, B.T. | Khaireh, B.A. | Kouriba, B. | Adu, B. | Pool, B. | McInnis, B. | Brook, C. | Williamson, C. | Nduwimana, C. | Anscombe, C. | Pratt, C.B. | Scheepers, C. | Akoua-Koffi, C.G. | Agoti, C.N. | Mapanguy, C.M. | Loucoubar, C. | Onwuamah, CK. | Ihekweazu, C. | Malaka, C.N. | Peyrefitte, C. | Grace, C. | Omoruyi, C.E. | Rafaï, C.D. | Morang'a, C.M. | Erameh, C. | Lule, D.B. | Bridges, D.J. | Mukadi-Bamuleka, D. | Park, D. | Rasmussen, D.A. | Baker, D. | Nokes, D.J. | Ssemwanga, D. | Tshiabuila, D. | Amuzu, D.S.Y. | Goedhals, D. | Grant, D.S. | Omuoyo, D.O. | Maruapula, D. | Wanjohi, D.W. | Foster-Nyarko, E. | Lusamaki, E.K. | Simulundu, E. | Ong'era, E.M. | Ngabana, E.N. | Okoth, Edward A. | Otieno, E. | Shumba, E. | Barasa, E. | Ahmed, E.B. | Ahmed, E.A. | Lokilo, E. | Mukantwari, E. | Philomena, E. | Belarbi, E. | Simon-Loriere, E. | Anoh, EA. | Manuel, E. | Leendertz, F. | Taweh, F.M. | Wasfi, F. | Abdelmoula, F. | Takawira, F.T. | Derrar, F. | Ajogbasile, F.V. | Treurnicht, F. | Onikepe, F. | Ntoumi, F. | Muyembe, F.M. | Ragomzingba, F.E.Z. | Dratibi, F.A. | Iyanu, F.A. | Mbunsu, G.K. | Thilliez, G. | Kay, G.L. | Akpede, G.O. | Zyl, G.U. van | Awandare, G.A. | Kpeli, G.S. | Schubert, G. | Maphalala, G.P. | Ranaivoson, H.C. | Omunakwe, H.E. | Onywera, H. | Abe, H. | Karray, H. | Nansumba, H. | Triki, H. | Kadjo, H.A.A. | Elgahzaly, H. | Gumbo, H. | Mathieu, H. | Kavunga-Membo, H. | Smeti, I. | Olawoye, I.B. | Adetifa, I.M.O. | Odia, I. | Ben, Boubaker, I.B. | Mohammad, I.A. | Ssewanyana, I. | Wurie, I. | Konstantinus, I.S. | Halatoko, J.W.A. | Ayei, J. | Sonoo, J. | Makangara, J.C. | Tamfum, J.M. | Heraud, J.M. | Shaffer, J.G. | Giandhari, J. | Musyoki, J. | Nkurunziza, J. | Uwanibe, J.N. | Bhiman, J.N. | Yasuda, J. | Morais, J. | Kiconco, J. | Sandi, J.D. | Huddleston, J. | Odoom, J.K. | Morobe, J.M. | Gyapong, J.O. | Kayiwa, J.T. | Okolie, J.C. | Xavier, J.S. | Gyamfi, J. | Wamala, J.F. | Bonney, J.H.K. | Nyandwi, J. | Everatt, J. | Nakaseegu, J. | Ngoi, J.M. | Namulondo, J. | Oguzie, J.U. | Andeko, JC. | Lutwama, J.J. | Mogga, J.J.H. | O'Grady, J. | Siddle, KJ. | Victoir, K. | Adeyemi, K.T. | Tumedi, K.A. | Carvalho, KS. | Mohammed, K.S. | Dellagi, K. | Musonda, K.G. | Duedu, K.O. | Fki-Berrajah, L. | Singh, L. | Kepler, L.M. | Biscornet, L. | Oliveira, Martins, L. de | Chabuka, L. | Olubayo, L. | Ojok, L.D. | Deng, L.L. | Ochola-Oyier, L.I. | Tyers, L. | Mine, M. | Ramuth, M. | Mastouri, M. | ElHefnawi, M. | Mbanne, M. | Matsheka, M.I. | Kebabonye, M. | Diop, M. | Momoh, M. | Lima, Mendonça, M.D.L. | Venter, M. | Paye, M.F. | Faye, M. | Nyaga, M.M. | Mareka, M. | Damaris, M.M. | Mburu, M.W. | Mpina, M.G. | Owusu, M. | Wiley, M.R. | Tatfeng, M.Y. | Ayekaba, M.O. | Abouelhoda, M. | Beloufa, M.A. | Seadawy, M.G. | Khalifa, M.K. | Matobo, M.M. | Kane, M. | Salou, M. | Mbulawa, M.B. | Mwenda, M. | Allam, M. | Phan, M.V.T. | Abid, N. | Rujeni, N. | Abuzaid, N. | Ismael, N. | Elguindy, N. | Top, N.M. | Dia, N. | Mabunda, N. | Hsiao, N.Y. | Silochi, N.B. | Francisco, N.M. | Saasa, N. | Bbosa, N. | Murunga, N. | Gumede, N. | Wolter, N. | Sitharam, N. | Ndodo, N. | Ajayi, N.A. | Tordo, N. | Mbhele, N. | Razanajatovo, N.H. | Iguosadolo, N. | Mba, N. | Kingsley, O.C. | Sylvanus, O. | Femi, O. | Adewumi, O.M. | Testimony, O. | Ogunsanya, O.A. | Fakayode, O. | Ogah, O.E. | Oludayo, O.E. | Faye, O. | Smith-Lawrence, P. | Ondoa, P. | Combe, P. | Nabisubi, P. | Semanda, P. | Oluniyi, P.E. | Arnaldo, P. | Quashie, P.K. | Okokhere, P.O. | Bejon, P. | Dussart, P. | Bester, P.A. | Mbala, P.K. | Kaleebu, P. | Abechi, P. | El-Shesheny, R. | Joseph, R. | Aziz, R.K. | Essomba, R.G. | Ayivor-Djanie, R. | Njouom, R. | Phillips, R.O. | Gorman, R. | Kingsley, R.A. | Neto Rodrigues, R.M.D.E.S.A. | Audu, R.A. | Carr, R.A.A. | Gargouri, S. | Masmoudi, S. | Bootsma, S. | Sankhe, S. | Mohamed, S.I. | Femi, S. | Mhalla, S. | Hosch, S. | Kassim, S.K. | Metha, S. | Trabelsi, S. | Agwa, S.H. | Mwangi, S.W. | Doumbia, S. | Makiala-Mandanda, S. | Aryeetey, S. | Ahmed, S.S. | Ahmed, S.M. | Elhamoumi, S. | Moyo, S. | Lutucuta, S. | Gaseitsiwe, S. | Jalloh, S. | Andriamandimby, S.F. | Oguntope, S. | Grayo, S. | Lekana-Douki, S. | Prosolek, S. | Ouangraoua, S. | Wyk, S. van | Schaffner, S.F. | Kanyerezi, S. | Ahuka-Mundeke, S. | Rudder, S. | Pillay, S. | Nabadda, S. | Behillil, S. | Budiaki, S.L. | Werf, S. van der | Mashe, T. | Mohale, T. | Le-Viet, T. | Velavan, T.P. | Schindler, T. | Maponga, T.G. | Bedford, T. | Anyaneji, U.J. | Chinedu, U. | Ramphal, U. | George, U.E. | Enouf, V. | Nene, Vishvanath M. | Gorova, V. | Roshdy, W.H. | Karim, W.A. | Ampofo, W.K. | Preiser, W. | Choga, W.T. | Ahmed, Y.A. | Ramphal, Y. | Bediako, Y. | Naidoo, Y. | Butera, Y. | Laurent, Z.R. de | Africa Pathogen Genomics Initiative | Ouma, A.E.O. | Gottberg, A. von | Githinji, G. | Moeti, M. | Tomori, O. | Sabeti, P.C. | Sall, A.A. | Oyola, Samuel O. | Tebeje, Y.K. | Tessema, S.K. | Oliveira, T. de | Happi, C. | Lessells, R. | Nkengasong, J. | Wilkinson, E.