Bifurcation analysis in a coffee leaf rust epidemiological model
2022
Djuikem, Clotilde | Grognard, Frédéric | Touzeau, Suzanne | Biological control of artificial ecosystems (BIOCORE) ; Centre Inria d'Université Côte d'Azur (CRISAM) ; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV) ; Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV) ; Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV) ; Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Laboratoire International de Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées (LIRIMA) ; Université Gaston Berger de Saint-Louis Sénégal (UGB)-Université de Yaoundé I (UY1)-Université Badji Mokhtar [Annaba] = Badji Mokhtar University [Annaba] = (عنابة) جامعة باجي مختار–عنابة (UBMA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université Joseph Ki-Zerbo de Ouagadougou = University of Ouagadougou (UJZK)-Université d'Antananarivo-Centre National de la Recherche Scientifique et Technologique (CNRST) | Université Côte d'Azur (UniCA) | Institut Sophia Agrobiotech (ISA) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Côte d'Azur (UniCA) | EPITAG
International audience
显示更多 [+] 显示较少 [-]英语. Coffee is an important cash crop cultivated in the tropics, which sustains the livelihood ofnot less than 125 million people worldwide. However, coffee plantations are subject tovarious diseases, among which coffee leaf rust (CLR), caused by fungus Hemileia vastatrix,which infects coffee leaves and can severely reduce coffee berry production.We developed a deterministic ODE model which describes the interaction between CLRand coffee branches in a coffee plantation. It is based on the classical SEIR epidemiologicalmodel, with an extra state variable for spores released by infected branches, which in turninfect susceptible branches. Moreover, coffee branches are subdivided into young andmature branches, the latter producing coffee berries. We computed the basic reproductionnumber R0, which classically determines the stability of the disease-free equilibrium(DFE), and studied the bifurcation around R0 = 1 using Castillo-Chavez and Song’stheorem.
显示更多 [+] 显示较少 [-]