ردیابی نشانه های انتخاب مثبت مرتبط با صفات مهم اقتصادی در نژادهای گوسفند ایرانی (زندی) و مصری (بارکی و راهمنی) با استفاده از روش hapFLK
2023
حسین محمّدی | حسین مرادی شهربابک | امیر حسین خلت آبادی فراهانی
انتخاب طبیعی و مصنوعی در جهت افزایش فراوانی جهشهای جدیدی که در برخی از جمعیتها مفید هستند باعث بر جای گذاشتن نشانههایی در سطح ژنوم میشود. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی نشانههای انتخاب بین نژادهای گوسفند بومی ایران با نژادهای مصری بود. بدین منظور از اطلاعات 96 رأس گوسفند زندی و 107 رأس گوسفند مصری (59 رأس بارکی و 48 رأس راهمنی) استفاده شد. پس از اجرای مراحل مختلف کنترل کیفیت دادهها، برای شناسایی نشانههای انتخاب از روش آماری hapFLK به وسیله نرمافزارhapFLK نسخه 4/1 استفاده شد. ژنهای کاندیدا با استفاده از چندشکلیهای تک نوکئوتیدی (SNP) که در بازه 1/0 درصد بالای ارزش hapFLK، واقع شده بودند با استفاده از برنامه BioMart شناسایی شدند. سپس عملکرد زیستی ژنها با استفاده از پایگاه اطلاعاتی PANTHER بررسی شده و برای تفسیر عملکرد ژنهای کاندیدا از پایگاههای برخط GeneCards و UniProtKB استفاده شد. نتایج حاصل از hapFLK نشان داد که در مقایسه جمعیت گوسفند بومی زندی با نژادهای مصر،ی هفت ناحیه ژنومی روی کروموزومهای یک، دو (سه منطقه)، 10، 25 و 26 شناسایی شدند. بررسی ژنهای گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژنهای DNAJB4، FNDC3B، GULP1، ACVR1 و FGF9 قرار داشتند. ژنهای موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، سازگاری، تعداد بره متولد شده و رشد عضلات مرتبط هستند. نتایج این تحقیق میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با صفات در نژادهای مختلف گوسفند فراهم آورد. به هر حال، جهت شناسایی دقیق این ژنها و جایگاههای کنترل کننده صفات کمّی یا QTLها لازم است مطالعات پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام شود.
显示更多 [+] 显示较少 [-]