Harilikus jõhvikas, leesikas ja sookailus esinevate endofüütsete seente kooslused

Endofüüdid on mikroorganismid, mis on tõenäoliselt olemas kõigis kõrgemates taimedes, kuid nende võimalikud kasulikud või kahjulikud omadused on suures osas veel teadmata. Kuigi teatud osa endofüütide poolt toodetud keemilisi aineid on juba kasutusel tööstuses, põllumajanduses ja meditsiinis, moodustavad need vaid väikese osa võimalikust ainete hulgast, mida võiksime leida. Töö eesmärgiks oli harilikust jõhvikast, leesikast ning sookailust endofüütsete seente eraldamine, nende liigiline määramine ning morfoloogiliste tunnuste kirjeldamine. Uurimus annab ülevaate kasutatud taimedest ja nende rakendamisest traditsioonilises meditsiinis, toetudes peamiselt ingliskeelsele kirjandusele, sisaldades teaduslikke artikleid, raamatuid ja teisi allikaid. Ravimtaimede kirjeldamisel on kasutatud Ain Raali (2010) teoseid ning Eesti ravimtaimede andmebaasi (2008). Töös on antud ülevaade ka endofüütsete seente puhaskultuuri viimisest, nende morfoloogiliste kirjelduste läbiviimisest ja molekulaarsest analüüsist. Töö käigus uuriti taimi kolmest eri piirkonnast. Kultuuridest välja valitud 55 puhaskultuuri puhul üheksa pärinesid harilikust jõhvikast, 21 leesikast ning 25 kultuuri sookailust. Sekveneermise läbis 24 puhaskultuuri. Märkimisväärseks võis pidada mikroskopeerimise käigus avastatud eoskottidega viljakeha, mis määrati endofüüdiks Physalospora vaccinii. Lõputöö annab ettekujutuse Eesti ravimtaimedes olevate endofüütide koosluste erinevusest nii taimeliigiti kui ka piirkonniti ja toob välja mitmekesisuse olemasolu liigivaestes kasvukohtades, nagu raba. Antud bakalaureusetööd on võimalik kasutada endofüütsete seente edasiseks uurimiseks ning hariliku jõhvika, leesika ning sookailu botaanilise iseloomustuse täiendamiseks. Magistritöös soovib autor jätkata olemasolevate kultuuride uurimist, et määrata täpsemalt kindlaks endofüüdi ja peremehe vahelisi suhteid ravimtaimedes.

Endophytes are microorganisms that are most likely present in all higher plants, but their potentially beneficial or harmful effects are still largely unknown. Some chemical substances produced by endophytes are already being exploited in industry, agriculture, and medicine, but they represent only a small amount of the possible huge amount still to be discovered. The purpose of this thesis was to isolate endophytic fungi from cranberry, bearberry and wild rosemary, determine their species and give their morphological descriptions. The thesis gives an overview of the plants studied and their use in traditional medicine based on literature mostly in English, containing scientific articles, books and other literature. Books by Ain Raal (2010) and Estonian medicinal plant database (2008) were used to describe medicinal plants. An overview about isolation methods and molecular and morphological techniques used, is given Plants from three different sites were studied. From 55 preselected cultures 9 cultures were isolated from cranberry, 21 from bearberry and 25 from wild rosemary. 24 endophytic fungus DNA were sequenced. Noteworthy was the discovery of a fruiting body with spore-sacs, which was determined as Physalospora vaccinii. The thesis gives an idea of the diversity of endophytic communities within medicinal plants in Estonia , with focus on possible host- and region-specific trends, and brings out the diversity of poor habitats like in a bog. This thesis can be used for further research on endophytic fungi and as addition to botanical description of cranberry, bearberry and wild rosemary. The author wishes to continue studies with existing cultures in her master's degree to determine the exact processes in host-endophyte relations in medicinal plant.