Développement d’outils moléculaires pour l’identification et l'étude de la distribution des 3 espèces de lamproies à l'échelle nationale
2022
Souissi, Ahmed | Besnard, Anne-Laure | Evanno, Guillaume | Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan (DECOD) ; Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Pôle OFB-INRAE-Institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement (MIAME) ; Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Office français de la biodiversité (OFB)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | OFB | Inrae | Institut Agro | UPPA
法语. Ce projet avait pour objectif de développer des marqueurs moléculaires permettant d’identifier les 3 espèces de lamproies présentes en France (Petromyzon marinus, Lampetra fluviatilis et L. planeri) et de détecter leur présence à partir d’ADN environnemental (ADNe). Nous avons testé l’utilisation d’un marqueur mitochondrial qui permet de distinguer P. marinus du genre Lampetra. Nous avons également développé un marqueur de l’ADN nucléaire dénommé diagLpf qui permet de distinguer L. fluviatilis et L. planeri par PCR quantitative. Ce marqueur est particulièrement utile pour identifier les ammocètes aux plus jeunes stades, qu’il est impossible d’identifier par des critères morphologiques. Enfin, avec le marqueur diagLpf, nous ne sommes pas parvenus à détecter la présence de lamproies à partir d’ADNe extrait avec des échantillons d’eau. De futures investigations dans ce domaine seront donc à développer avec les nouvelles techniques disponibles telles que la PCR digitale.
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