Metagenomics and population genomics of honey bees through the direct sequencing of honeys
2024
Teixido, Noemie | Simon, Elisa | Labarthe, Emmanuelle | Rottier, Emilien | Basso, Benjamin, B. | Mondet, Fanny | Vignal, Alain | Canale Tabet, Kamila | Leroy, Thibault | Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE) ; Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Abeilles et Environnement (AE) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | UMT Protection des abeilles dans l’environnement (UMT PrADE) ; Association pour le Developpement de l'Apiculture Provencale (ADAPI)-Institut de l'abeille (ITSAP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Terres Inovia-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | SFBI
International audience
显示更多 [+] 显示较少 [-]英语. Over the last decade, taking advantage of the small genome size of honey bees(225 Mb) and the fact that males (drones) are haploïd, our research team located atINRAE in Toulouse, France, has built up a large dataset of phased honey beegenomes. However, sample collection requires regular visits to the hives, which canbe an issue for large regional sampling.Therefore, our “Mallaurie'' project aims at testing a potential alternative by directshotgun sequencing of honey samples,. This approach could have several associated advantages : (i)non-lethal sampling, (ii) lower carbon footprints (iii) easy access to a larger diversitygiven the importance of the worldwide market and (iv) access to metagenomic data,such as microbiome, parasites, plants etc.
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