Shallow sequencing: a cost-effective and accurate alternative to WGS for taxonomic profiling ?

Goutorbe, Benoit; Abraham, Anne-Laure; Mariadassou, Mahendra; Loux, Valentin; Rué, Olivier; Plauzolles, Anne; Bidaut, Ghislain; Halfon, Philippe; Schbath, Sophie; Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]  ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement; ALPHABIO - Laboratoire de biologie médicale; Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille  ; Aix Marseille Université -Institut Paoli-Calmettes  ; Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer -Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale -Centre National de la Recherche Scientifique

Shallow sequencing: a cost-effective and accurate alternative to WGS for taxonomic profiling ?

2020

Goutorbe, Benoit | Abraham, Anne-Laure | Mariadassou, Mahendra | Loux, Valentin | Rué, Olivier | Plauzolles, Anne | Bidaut, Ghislain | Halfon, Philippe | Schbath, Sophie | Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas] (MaIAGE) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | ALPHABIO - Laboratoire de biologie médicale | Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM) ; Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes (IPC) ; Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

International audience

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