Morphological and molecular characterization of ring nematodes (Nematoda: Criconematidae) from Costa Rica: two new species described | Caracterización morfológica y molecular de nematodos anillados (Nematoda: Criconematidae) de Costa Rica: dos nuevas especies descritas
2024
Aráuz-Badilla, J. | Artavia-Carmona, R. | Hilje-Rodríguez, I. | Castillo, Pablo | Peraza-Padilla, Walter | Universidad Nacional de Costa Rica
[EN] Plant-parasitic nematodes cause significant economic impact on agricultural crops. Among these, the members of the Criconematidae, ring nematodes, are considered as potential pests due to a strong stylet and worldwide distribution. In Costa Rica, there are several reports of ring nematodes associated with different plant species, however, there are no molecular studies of the species present in the country. The aim of this study was to identify nematodes of the Criconematidae family, using morphological and molecular methods to contribute to the knowledge of these organisms. Soil samples were collected from cocoa, sugar cane, grass, and natural areas from five provinces in Costa Rica. A morphological study was conducted using a set of measurements, percentages, and ratios to differentiate ring nematodes species. Molecular analysis included amplification of 28S D2D3 domain, 18S, ITS, and COI regions, which allowed phylogenetic analysis between species identified in this study and those deposited in GenBank. Four species of ring nematodes were identified, including two new species, which are described herein, for the first time in this study. Mesocriconema onoense and Mesocriconema costarricense n. sp. were identified in natural areas, Mesocriconema paraonoense n. sp. in cocoa and sugar cane plantations, and Mesocriconema sphaerocephalum in grass. This research reports the first morphological and molecular characterization of nematodes belonging to the Criconematidae in Costa Rica.
显示更多 [+] 显示较少 [-][ES] Los nematodos fitoparásitos son organismos que causan un impacto económico significativo en los cultivos agrícolas. Entre estos, miembros de la familia Criconematidae, los nematodos anillados, se consideran una plaga potencial debido a su amplia distribución mundial y que poseen un fuerte estilete en su aparato bucal. En Costa Rica existen varios reportes de nematodos anillados asociados a diferentes especies de plantas, sin embargo, no existen estudios moleculares de las especies presentes en el país. El objetivo de este estudio fue identificar nematodos de la familia Criconematidae utilizando métodos morfológicos y moleculares, para contribuir al conocimiento de estos organismos. Se recolectaron muestras de suelo de cacao, caña de azúcar, pastos y áreas naturales de cinco provincias de Costa Rica. Se realizó un estudio morfológico a partir de una serie de medidas, porcentajes y proporciones para diferenciar entre especies de nematodos anillados. El análisis molecular incluyó la amplificación de las regiones D2D3, 18S, ITS y COI, las cuales permitieron establecer relaciones filogenéticas entre las especies identificadas en este estudio y las especies disponibles en la base de datos del GenBank. Se identificaron en total cuatro especies de nematodos anillados, que incluyendos especies nuevas descritas por primera vez en este estudio. Se identificó Mesocriconema onoense y Mesocriconema costarricense n. sp. en áreas naturales, Mesocriconema paraonoense n. sp. en plantaciones de cacao y caña de azúcar, y Mesocriconema sphaerocephalum en pastos. Esta investigación representa el primer estudio morfológico y molecular de nematodos pertenecientes a la familia Criconematidae en Costa Rica.
显示更多 [+] 显示较少 [-]This research was supported by Laboratorio de Nematología from Universidad Nacional (UNA), Costa Rica.
显示更多 [+] 显示较少 [-]Peer reviewed
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