Nutzung der genetischen Diversität für Assoziationsstudien in Gerste (Hordeum vulgare L.) | Utilization of Genetic Diversity for Association Studies in Barley (Hordeum vulgare L.)

德语. Verschiedene Wintergerstesorten (64 mehr- und 49 zweizeilige), welche im Zeitraum 1959 bis 2003 in Deutschland zugelassen waren, wurden über 3 Jahre an jeweils 12 verschiedenen Standorten in Feldversuchen untersucht. Dabei wurden agronomische Merkmale wie der Kornertrag, die Ertragsstrukturkomponenten, der Proteingehalt und das Resistenzniveau gegen verschiedene Pathogene erfasst. Basierend auf der SNP (Single Nucleotide Polymorphism)-Detektion mittels des Illumina GodenGate Assays, deren Ergebnisse gemeinsam mit den phänotypischen Merkmalsdaten in Assoziationsstudien genutzt wurden, konnten zahlreiche Einzelnukleotidunterschiede detektiert werden, die mit einer entsprechenden phänotypischen Merkmalsausprägung korreliert sind. Basierend auf diesen Ergebnissen werden CAPS (Cleavead Amplified Polymorphic Sequence)-Marker und Primer für die Pyrosequenzierung entwickelt, die anschließend in der praktischen Züchtung eine Nutzung dieser Ergebnisse erlauben sowie eine Verifikation der entsprechenden Assoziationen in spaltenden doppelhaploiden (DH)-Populationen.

英语. Several winter barley cultivars (64 six-rowed and 49 two-rowed) released in Germany in the period 1959- 2003 have been phenotyped in three years at 12 locations each, for yield, yield components, protein content, lodging, and resistance to several pathogens. Furthermore, all these cultivars were analysed using the Illumina Golden Gate assay for Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). This provides detailed information on the genome-wide genetic diversity present in cultivated barley. Based on statistical tools robust marker trait associations based on broad phenotypic and genotypic data were identified. As Illumina markers are not directly applicable in barley breeding programmes, they will be converted to easy to handle SNP-markers (CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence), pyrosequencing) which facilitate a use of these results in applied barley breeding and a verification of respective marker trait associations in doubled haploid lines (DHs).