OpenSILEX, des systèmes d’information pour des données expérimentales FAIR
2023
Rigolle, Valentin | Besombes, Gabriel | Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Département mathématiques, informatique, sciences de la donnée et technologies du numérique (MathNum) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | INRAE
International audience
显示更多 [+] 显示较少 [-]法语. Les données de recherche sont de plus en plus complexes et doivent évoluer en permanence pour répondre aux défis scientifiques d'aujourd'hui et de demain. Les systèmes d'information des communautés de recherche doivent donc être capables de gérer cette complexité et de répondre aux exigences d'une science ouverte et reproductible. En réponse à ces défis, nous avons développé OpenSILEX, une suite logicielle qui permet de construire des systèmes d'information et de mettre en œuvre les principes FAIR. Ces systèmes sont basés sur des ontologies. OpenSILEX est dérivé sous plusieurs implémentations correspondant à des communautés scientifiques spécifiques : PHIS (phénotypage de plantes à haut débit), Sixtine (unités expérimentales de plantes à l'INRAE), Silex-VitiOeno (vin et viticulture), Silex-LBE (dépollution). L'implémentation de PHIS est le système d'information du projet Phenome. Il propose, au-delà de la gestion des données, un vocabulaire structuré pour un meilleur partage des données au sein de la communauté.
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