Atosan, a new exopolysaccharide secreted by a Vibrio alginolyticus strain isolated from a deep-sea hydrothermal vent environment
2025
Zykwinska, Agata | Calatraba, Méline | Bonnetot, Sandrine | Marchand, Laëtitia | Fanuel, Mathieu | Ollivier, Simon | Ropartz, David | Le Gall, Sophie | Thoulouze, Loric | Marais, Bérengère | Cuenot, Stéphane | Cerantola, Stéphane | Colliec-Jouault, Sylvia | Delbarre-Ladrat, Christine | Unité Microbiologie Aliment Santé Environnement (MASAE) ; Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER) | Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan (DECOD) ; Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | BIBS - Plateforme Bioressources : Imagerie, Biochimie & Structure ; Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INRAE, PROBE Research Infrastructure | INRAE, PROBE Research Infrastructure | Institut des Matériaux de Nantes Jean Rouxel (IMN) ; Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Nantes université - UFR des Sciences et des Techniques (Nantes univ - UFR ST) ; Nantes Université - pôle Sciences et technologie ; Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Sciences et technologie ; Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - Ecole Polytechnique de l'Université de Nantes (Nantes Univ - EPUN) ; Nantes Université - pôle Sciences et technologie ; Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ) | Service Commun RMN-RPE ; Université de Brest (UBO) | ANR-17-CE08-0001,FunCapsul,Conception de nouvelles matrices fonctionnelles pour l'encapsulation à base de polymères synthétisés par des bactéries marines(2017) | ANR-10-INBS-0009,France Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010) | ANR-11-INBS-0013,IFB (ex Renabi-IFB),Institut français de bioinformatique(2011)
International audience
显示更多 [+] 显示较少 [-]英语. Bacteria are able to colonize various environments, even the most hostile ones, due to their ability to synthesize an extracellular protective matrix. Bacteria isolated from deep-sea hydrothermal vent environments have been identified as very effective producers of polysaccharide-rich matrix. In particular, exopolysaccharides (EPS) synthesized by Vibrio marine species have shown to be composed of uronic acid and hexosamine residues, similarly to glycosaminoglycans, components of mammalian tissues. In the present study, the fine structure of a new high-molecular weight EPS, named atosan, secreted by the deep-sea hydrothermal vent bacterium Vibrio alginolyticus AT1219 strain, was determined. A complementary analytical approach, including Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy and mass spectrometry was applied to elucidate the repeating unit of the polysaccharide. A linear pentasaccharide with a unique monosaccharide sequence: [→3)-α-d-Galp-(1→3)-β-d-GalpA-(1→3)-β-d-GlcpNAc-(1→4)-α-d-GalpNAc-(1→4)-β-d-GlcpA-(1→] was described. In parallel, the genome sequence was investigated to get insight into the genetic mechanisms of atosan biosynthesis. Amongst eight clusters assigned to carbohydrate biosynthesis, three of them were closely related to the biosynthesis of the extracellular polysaccharide. Determination of the fine structure of atosan is a prerequisite step to better understand the relationship between its structure and resulting functional properties.
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