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Seventy-one percent of the earth surfaces is covered by oceans. Water therefore is an important habitat for microorganisms and the other living beings. A consistent microbial biodiversity is present in water from phototrophs to chemioorganotrophs. The complex relationships between different microorganisms and the environment are often modified by organic, chemical and physic contaminations. The input of organic material can determine pathogenic pollution. The presence of pathogens has to be monitored to eliminate serious problems for animal and human health. Water, in fact, can be a vehicle direct (drinking water) or indirect (irrigation water) for microbial pathogens | Il 71% della superficie terrestre è costituito dagli oceani. L'acqua pertanto è un importante ambiente per i microrganismi, oltre che per tutti gli altri esseri viventi. Una grande varietà di tipi microbici colonizzano l'habitat acquatico, dai fototrofi ai chemiorganotrofi. Le dinamiche che si creano fra i diversi componenti microbici e l'ambiente sono spesso alterate da contaminazioni organiche, chimiche e fisiche. L'immissione di materiale organico può anche essere fonte di inquinamento di microrganismi patogeni la cui presenza va monitorata al fine di evitare seri problemi alla salute umana e animale. L'acqua, infatti, può rappresentare un veicolo di trasferimento, sia diretto (acqua potabile), sia indiretto (acque di irrigazione), di microrganismi patogeni

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