Genetic variability and structure of common carp (Cyprinus carpio) populations throught the distribution range inferred from allozyme, microsatellite and mitochondrial DNA markers | Variabilité et structuration génétique des populations de carpe (Cyprinus carpio) d'après la gamme de distribution des marqueurs : allozymes, microsatellites et ADN mitochondrial

Francés. Les stocks de carpes domestiquées et les populations de carpes sauvages de l'Europe, de l'Asie centrale, de l'Asie du Sud-Est et d'Extrême-Orient ont été examinés pour étudier les variations en allozymes (23 populations), en microsatellites (11 populations) et en ADN mitochondrial (21 populations). La variabilité en allozymes (1,06 à 1,81 allèles par locus, hétérozygotie attendue 0,006 à 0,136 pour 16 loci) est largement inférieure à la variabilité des microsatellites (2,5 à 14 allèles par locus, hétérozygotie attendue 0,426 à 0,887 à 4 loci). Les différences en variabilité entre stocks domestiqués et carpes sauvages sont plus prononcées aux loci de microsatellites qu'à ceux des allozymes, laissant penser que les microsatellites sont mieux adaptés pour détecter des goulots d'étranglement et la perte de variation due à la consanguinité. Toutes les populations à l'exception de celle de l'Europe ont été fixées pour un seul haplotype mitochondrial mtDNA qui domine également en Asie centrale mais qui est complètement absent en Asie du Sud-Est et Extrême-Orient, indiquant une origine unique pour la carpe européenne en Asie centrale. Les trois classes de marqueurs génétiques sont groupées en deux groupes hautement divergents : Europe-Asie centrale et Sud-Est asiatique-Extrême-Orient. La partition hiérarchique de la diversité génétique montre que la plupart de la variation chez les loci de microsatellites est due à la composante intra-populations, tandis que la plus grande proportion de variation de mtADN et une partie substantielle de la variation des allozymes proviennent des différences entre régions géographiques. Les données génétiques confortent le statut de sous-espèces à C. c. carpio assignée à la carpe européenne et C. c. haematopterus assignée à la carpe du Sud-Est asiatique et d'Extrême-Orient mais ne justifient pas un statut de sous-espèce pour la carpe d'Asie centrale (C. c. aralensis). Comme pour les carpes sauvages du Danube, Allemagne, les marqueurs génétiques utilisés dans cette étude pour une population sauvage peuvent effectivement être appliqués pour détecter des introgressions d'unités intraspécifiques et des mélanges en présence de différentiation génétique suffisante