The genetic variability of the Podolica cattle breed from the Gargano area. Preliminary results [Apulia]

Inglés. The Podolica cattle breed is autochthonous of Southern Italy and denoted by its particular rusticity. This study presents the preliminary results of genetic characterization of Podolica breed using DNA STR markers. A total of 20 microsatellite loci were analysed in 79 individuals reared in the Gargano area. Number of polymorphisms, allele frequencies, deviations from Hardy-Weinberg proportions, linkage disequilibrium between loci and genetic similarities between animals were calculated. The results showed a high deficiency of heterozygotes, the observed mean of heterozygosis being 0.449, whereas the expected mean was 0.766. Many markers showed also deviations from the Hardy-Weinberg proportions and significant linkage disequilibrium between loci. However, the genetic similarity within the population was low (0.281) and the average number of alleles per locus was high (10), representing a high genetic variability. In order to explain these results, a stratification of the breed in sub-populations with a high interior genetic homogeneity, but a markedly differentiated one from each other could be hypothesized; this situation probably derived from non-random mating within each herd (consanguinity) and from the lack of exchange of genetic material between the herds. A further study is needed on a wider sample and extending the analysis to FAO-ISAG microsatellite panel in order to confirm this hypothesis. This could eventually provide the information necessary for the correct management of the reproductive schemes and for genomic traceability of meat production

Italiano. Vengono riferiti i risultati di un'indagine preliminare sulla variabilità genetica della razza bovina Podolica, caratterizzata da doti di rusticità e frugalità, condotta avvalendosi di metodologie molecolari. Sono stati analizzati 20 microsatelliti del DNA su un campione di 79 soggetti Podolici presenti sul territorio garganico. L'analisi statistica ha considerato i seguenti parametri: numero di alleli per locus, frequenze alleliche, deviazioni dalle proporzioni di Hardy-Weinberg, linkage disequilibrium tra i loci e rassomiglianza genetica tra i soggetti indagati. I risultati mostrano una consistente deviazione dalle proporzioni di Hardy-Weinberg, associata a difetto di eterozigoti e linkage disequilibrium significativo per molti loci. L'eterozigosi media osservata è pari a 0,449, contro un'eterozigosi media attesa di 0,766. Si è tuttavia anche osservata una bassa rassomiglianza genetica (0,281) e un numero medio di alleli per locus pari a 10 all'interno della popolazione studiata. Una possibile interpretazione dei risultati potrebbe considerare l'esistenza, nella popolazione, di sottopopolazioni geneticamente omogenee al loro interno, ma ben differenziate le une dalle altre. Tale tendenza potrebbe derivare dalla presenza di legami di parentela tra i soggetti, causata da accoppiamenti non casuali all'interno delle singole aziende e dal mancato scambio di materiale genetico tra le aziende. In questo modo sarebbe possibile spiegare sia l'elevata variabilità genetica, sia l'eccesso di omozigoti. Un ulteriore studio condotto su un più ampio campione e l'ampliamento dei loci analizzati a favore del panel raccomandato FAO-ISAG potrà permettere di confermare queste ipotesi e di giungere alle opportune valutazioni, per una più corretta gestione riproduttiva, nonché per la tracciabilità molecolare della produzione della carne