Tatra taimes ja seemnetes esinevate mükotoksiine produtseerivate seente arvukus Eestis ja mükotoksiinidega saastumise risk | The abundance of mycotoxin-producing fungi in buckwheat seeds and the risk of mycotoxin contamination

Tatra kasvupind Eestis on viimase 10 aasta jooksul kasvanud 13 korda. 2017. aasta seisuga onkogu tatra pinnast 72% mahetootmises, kus ei tohi kasutada sünteetilisi taimekaitsevahendeidtõrjumaks võimalikke patogeene. Paraku puudub tatral täna lävend tooraine turule saatmiselinimorganismile ohtlike mükotoksiinide sisalduse suhtes. Töö eesmärgiks oli koguda erinevadtatra seemnepartiid ning määrata neis esinevad mükotoksiine tootvad seened ning nendearvukus. Töös uuriti 8 erinevat partiid 7 erinevalt tootjalt. Nendest kasvatati väljapuhaskultuurid, eraldati DNA ning seente universaalpraimerite abil teostati PCR analüüs.Saadud produktid sekveneeriti ning järjestuse võrdluses andmebaasidega tuvastati seentetaksonoomiline kuuluvus. Fusarium spp. tuvastamiseks teostati perekonnaspetsiifilisepraimeriga PCR analüüs. Töö tulemusena tuvastati partiidest 29 erinevat seeneliiki võiperekonda, nendest potentsiaalselt mükotoksiine tootvaid oli 14, ehk 48%, kuulusid needAlternaria, Fusarium, Cladosporium, Aspergillus ja Penicillium perekondadesse. Fusarium spp.proov oli positiivne kõigil Eesti päritolu partiidel, ainsana oli Fusariumi suhtes negatiivneLeedust pärit Rimi seemnepartii. Tulemused näitavad, et Eestis turustatavatel tatra partiidel esineb potentsiaalselt mükotoksiine tootvaid seeneliike. Edasi tuleks laiendada analüüsitavatepartiide hulka, et saada ette laiem pilt olukorrast.

Inglés. The population of buckwheat has grown over 13 times in last 10 years. By the year 2017 72% of itsgrowth area was organic, where using synthetic fungicides is prohibited. Unfortunately there are no limitsfor mycotoxin contain, that are toxicous for human. The aim of this study was to collect different batchesof buckwheat to determine abundance of mycotoxin-producing fungi. Reasearch covered 8 differentbatches from 7 producers. Purecultures were grown out, DNA was isolated and PCR analysis wasperformed using universal primers. The resulting product was sequenced and the taxonomic affiliationof the fungi was determined by comparison with databases. For detection of Fusarium spp. PCR analysiswith family-specific primers was carried out. As a result of this research 29 different fungal species orfamilies were identified, 14 (48%) of which were potentially mycotoxin-producing, belonging toAlternaria, Fusarium, Cladosporium, Aspergillus and Penicillium families. All of Estonian originatedbatches were Fusarium positive, only negative was from Lithuania, sold by Rimi. The results show thatbuckwheat on the Estonian market is contaminated with potentially mycotoxin-producing fungi. Furtherwider analysis is needed to carry out to get wider picture of fungi potentially contaminating seeds.

MagistritööPõllumajandussaaduste tootmise ja turustamise õppekaval