[EN] In this PhD thesis, we contribute to a more detailed knowledge of the biogeography of coccolithophores in one of the most productive marine ecosystem on earth: the Peru-Chile Current realm, which extends along the west coast of South America. | [ES] En esta tesis se contribuye a un mayor conocimiento de la biogeografía de los Cocolitóforos en uno de los ecosistemas marinos más productivos de nuestro planeta: el sistema de corrientes de Perú- Chile, que se extiende a lo largo de la costa oeste de Suramérica.

Introduction: The Pseudothelphusidae is a very diverse family of primary freshwater crabs widely distributed throughout the Neotropical region, but the true extent of the geographic distribution of several species is poorly known because many of them occur in very remote areas with only a single or very few records available. Objective: Here we present new country records for four species of pseudothelphusid crabs from Meso- and South American countries. Methods: The data about the geographic distribution are based on specimens deposited in crustacean collections of institutions from Brazil, Germany, and USA; illustrations of the male first gonopod were prepared in stereomicroscope equipped with a camera lucida. Results: Occurrence records of Phygiopilus acanthophallus Fredius stenolobus from Guyana, and Kunziana irengis from Brazil are published for the first time, and the occurrence of Raddaus mertensi from Honduras is confirmed. Comments on the morphology of the male first gonopod of each species are given, their range extensions are discussed, and the importance of these new records for conservation assessments is highlighted. Conclusions: The new data expand the area of occurrence of these four species of Pseudothelphusidae freshwater crabs, providing new data that are relevant for taxonomic and biogeographical studies as well as for the development of better regional and national assessments of the conservation status of the aquatic fauna. | Introducción: Pseudothelphusidae es una familia muy diversa de cangrejos primarios de agua dulce ampliamente distribuida por toda la región Neotropical, pero la verdadera extensión de la distribución geográfica de varias especies es poco conocida porque muchas de ellas viven en zonas muy remotas de las que sólo se dispone de un único registro o de muy pocos. Objective: Aquí presentamos nuevos registros nacionales para cuatro especies de cangrejos pseudotelfusidos de países de Meso- y Sudamérica. Métodos: Los datos sobre la distribución geográfica se basan en especímenes depositados en colecciones de crustáceos de instituciones de Brasil, Alemania y Estados Unidos; se prepararon ilustraciones del primer gonópodo masculino en un microscopio estereoscópico equipado con una cámara lúcida. Resultados: Se publican por primera vez los registros de ocurrencia de Phygiopilus acanthophallus en México, Fredius stenolobus en Guyana y Kunziana irengis en Brasil, y se confirma la presencia de Raddaus mertensi en Honduras. Se dan comentarios sobre la morfología del primer gonópodo masculino de cada especie, se discuten sus extensiones de distribución y se destaca la importancia de estos nuevos registros para las evaluaciones de conservación. Conclusiones: Los nuevos datos de la distribución geográfica amplían las áreas de ocurrencia de estas cuatro especies de cangrejos dulceacuícolas de la familia Pseudothelphusidae, proporcionando nuevos datos que son relevantes para estudios taxonómicos y biogeográficos, así como para el desarrollo de mejores evaluaciones regionales y nacionales del estado de conservación de la fauna acuática.

Microorganisms play a key role in aquatic biogeochemical cycles and in the flow of matter and energy through planktonic food webs. The first two chapters of this thesis aimed to investigate the main factors affecting bacterial abundances in tropical freshwater environments, due to an apparent paradox which emerged from previous studies: despite the higher bacterial production in the tropics, the bacterial abundance found in those regions is lower, compared to temperate environments. This fact raised the hypothesis that bacterial abundance could be controlled by heterotrophic flagellates in the lower latitudes. By analyzing a large data set, we showed that both bacterial and heterotrophic flagellate abundances are consistently lower in tropical when compared to temperate regions, resulting in a similar coupling between those communities. A stronger top-down control on both microbial communities exerted by ciliates and cladocerans, may explain those patterns. The experimental approach allowed us to demonstrate that protists, mainly ciliates, are likely the main responsible for bacterial loss in a tropical lake and that predation pressure also influences bacterial community size-structure. In the third chapter, we aimed to comprehend the role of temporal and spatial scales in structuring the planktonic ciliate communities from Neotropical floodplains, through a metacommunity approach. Contrasting results have been reported in the literature: while some authors advocated that microorganisms have a cosmopolitan distribution, others argued that they displayed biogeographic patters similar to those found for larger sized organisms. Taking into account both spatial and temporal scales, our analysis allowed us to demonstrate a clear influence of the temporal variation in structuring the planktonic ciliate communities, and with the analysis of a great spatial extent, it was possible to verify that biogeographic patterns also occur for those small-sized organisms. | Os microrganismos são fundamentais nos ciclos biogeoquímicos e participam ativamente do fluxo de matéria e energia através das teias alimentares planctônicas. Investigou-se os principais fatores que afetam a abundância bacteriana em ambientes de água doce tropicais, uma vez que um aparente paradoxo surgiu de estudos prévios: apesar da maior produção bacteriana encontrada em regiões tropicais, quando comparada à das regiões temperadas, menores abundâncias bacterianas eram registradas. Esse fato levantou a hipótese de que a abundância bacteriana seria controlada por flagelados heterotróficos nos trópicos. Através da análise da base de dados de diversos ambientes tropicais, constatamos que tanto a abundância bacteriana quanto a de flagelados heterotróficos é consistentemente menor em regiões tropicais quando comparada à das regiões temperadas, resultando em um acoplamento similar entre essas comunidades. Um maior controle top-down exercido sobre ambas as comunidades microbianas por ciliados e cladóceros, pode explicar os padrões encontrados. A abordagem experimental demonstrou que os protistas, principalmente os ciliados, são provavelmente os principais responsáveis pela perda bacteriana em uma lagoa tropical, e que a pressão de predação também influencia a estrutura de tamanho da comunidade bacteriana. Investigaram-se também, na estruturação da comunidade de ciliados planctônicos de planícies de inundação Neotropicais, as escalas temporais e espaciais, através da abordagem de metacomunidades. Estudos acerca desse tema mostraram resultados contraditórios: enquanto para alguns os microrganismos apresentavam uma natureza cosmopolita, para outros, padrões biogeográficos seriam semelhantes àqueles encontrados em macrorganismos. Análise da escala espaço-temporal indicou a influência da variação temporal na estruturação da comunidade de ciliados. Conforme a análise de uma grande extensão espacial foi possível verificar que padrões biogeográficos também ocorrem para organismos de pequeno tamanho. | PhD