Mise au point de méthodes de détection des souches d’Escherichia coli productrices de Shiga-toxines (STEC)

Французский. Les Escherichia coli producteutrices de Shiga-toxines (STEC) sont des agents pathogènesimportants émergents en santé publique. Ces bactéries sont à l’origine des épidémies decolites hémorragiques et de syndrome hémolytique et urémique (SHU). La grande majoritédes cas est liée à la consommation d’aliments contaminés par un type particulier de STECappelés E. coli entérohémorragiques (EHEC) parmi lesquels on trouve les sérogroupes définiscomme pathogènes par l’AFSSA : O26, O103, O111, O145 et O157.Les bovins ont depuis longtemps été identifiés comme un important réservoir de STEC. Bienque la transmission des STEC à l'homme soit fréquemment associée à la consommation deviande, les produits laitiers ont également été impliqués dans les cas humains. Ledéveloppement de méthodes rapides pour la détection des STEC les plus impliqués enpathologie humaine est donc essentiel pour assurer la sécurité des produits alimentaires.Cependant, la détection des STEC dans les aliments est une problématique principalement enraison de la diversité des sérogroupes de STEC et de l'absence de caractéristiquesbiochimiques communes permettant de les distinguer des autres E. coli.L'objectif de cette mémoire était d’optimiser le protocole de détection des STEC dans lesaliments de manière à pouvoir proposer aux industriels des protocoles leur permettant unemaîtrise du « danger STEC » dans leur filière.Pour se faire, nous sommes intervenus à différentes étapes du protocole. Nous avonsnotamment sélectionné un milieu d’enrichissement permettant la détection des E. coli O26dans les fromages au lait cru : EPT+ acriflavine + CT. Nous avons également évalué lesperformances d’une méthode de détection des E. coli O157:H7 (VIDAS ECPT UP) dans laviande de boeuf. Cette nouvelle technique est basée sur l’utilisation de protéines recombinantede phage qui ciblent spécifiquement les E. coli O157. A travers cette étude, nous avonsdémontré la possibilité d’avoir des temps d’enrichissement minimes pour l’analysed’échantillon de 25g (6h) et la faisabilité d’analyser des échantillons de 375g avec un ratio dedilution de ¼ et un enrichissement de 24h.