Caractérisation phénotypique et moléculaire de la collection nationale de ressources génétiques de blé tendre

The bread wheat national collection, gathering 1783 French accessions, was evaluated during threeyears for ten agro-morphological traits in a multisite network of private breeders. Furthermore, the wholecollection was genotyped for a set of 42 microsatellite loci. Field evaluation results show a wide diversityfor all observed traits. ANOVA performed on heading date, plant height, spike density and lodgingsusceptibility indicates both high significant genotype and year effect, without interaction. The use ofempiric selection index on disease traits (yellow and brown rusts, septoria, fusarium and powderymildew) makes it possible to define different panels of accessions showing high level of resistance foreach specific pathogen.Molecular analysis also reveals a large diversity at neutral level. From genotyping data, clusteringanalysis of the whole collection exhibits the importance of registration year effect on structure of thewhole collection. A first approach of association genetics between markers and traits indicates a total of130 significant associations (p<0.001).The national collection was declared as French contribution to the TIRPAA (international treaty ongenetic resources for food and agriculture). Seeds from this collection are freely available in order to beused in breeding programsThe whole passport and evaluation dataset of this collection is currently transferred on the nationaldatabase SIReGaL and will be soon accessible on internet

La collection nationale blé tendre, regroupant 1783 accessions françaises, a été évaluée sur trois anspour dix caractères agro-morphologiques (précocité, hauteur, compacité et aristation de l’épi, sensibilitéà la verse, sensibilité aux rouilles jaunes, rouilles brunes, fusarioses, oïdium et septorioses) dans leréseau multilocal des sites de sélection des partenaires privés membres de l’UFS. Par ailleurs, lacollection a été génotypée pour 42 locus microsatellites répartis sur l’ensemble du génome.Les résultats d’évaluations agronomiques mettent en évidence une large variabilité pour l’ensemble descaractères observés. Une analyse de variance menée sur la précocité, la hauteur, la compacité,l’arisation et la sensibilité à la verse révèle de forts effets principaux du génotype et de l’année pour laplupart de ces variables, tandis que leurs interactions sont négligeables. L’application d’un indexempirique de sélection sur les caractères de sensibilités aux maladies a permis de définir différentspanels d’accessions montrant de bons niveaux de résistances aux cinq pathogènes étudiés.L’analyse au niveau moléculaire révèle également une grande diversité au niveau du polymorphismeneutre. A partir de ces données, une analyse de la structure de la collection a confirmé l’importance dela date d’inscription des variétés comme facteur structurant fortement la collection. Par la suite, unepremière approche de génétique d’association a permis de révéler 130 associations statistiquementsignificatives entre phénotypes et génotypes aux marqueurs étudiés.La collection nationale a été déclarée comme contribution française auprès de la FAO dans le cadre dutraité international sur les ressources phytogénétiques. Elle est à ce titre largement diffusée sous formede semences auprès de la communauté internationale.L’ensemble des données d’évaluations du projet est en cours de transfert sur la base de donnéesinformatisées SIReGaL et sera bientôt publiquement accessible sur le net