VirHostNet : a knowledge base for the management and the analysis of proteome-wide virus-host interaction networks
2009
Navratil, Vincent | de Chassey, Benoit | Meyniel, Laurène | Delmotte, Stephane | Gautier, Christian | André, Patrice | Lotteau, Vincent | Rabourdin-Combe, Chantal | Rétrovirus et Pathologie Comparée (RPC) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL) | BioSciences Lyon-Gerland (BLG) ; École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Baobab [LBBE] ; Département PEGASE [LBBE] (PEGASE) ; Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE) ; Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE) ; Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Unité mixte de recherche retrovirus et pathologie comparée ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL) | Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE) ; Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
International audience
Показать больше [+] Меньше [-]Английский. Infectious diseases caused by viral agents kill millions of people every year. The improvement of prevention and treatment of viral infections and their associated diseases remains one of the main public health challenges. Towards this goal, deciphering virus-host molecular interactions opens new perspectives to understand the biology of infection and for the design of new antiviral strategies. Indeed, modelling of an infection network between viral and cellular proteins will provide a conceptual and analytic framework to efficiently formulate new biological hypothesis at the proteome scale and to rationalize drug discovery. Therefore, we present the first release of VirHostNet (Virus-Host Network), a public knowledge base specialized in the management and analysis of integrated virus-virus, virus host and host-host interaction networks coupled to their functional annotations. VirHostNet integrates an extensive and original literature-curated dataset of virus-virus and virus-host interactions (2671 non-redundant interactions) representing more than 180 distinct viral species and one of the largest human interactome (10 672 proteins and 68 252 non-redundant interactions) reconstructed from publicly available data. The VirHostNet Web interface provides appropriate tools that allow efficient query and visualization of this infected cellular network. Public access to the VirHostNet knowledge-based system is available at http://pbildb1.univ-lyon1.fr/virhostnet.
Показать больше [+] Меньше [-]Ключевые слова АГРОВОК
Библиографическая информация
Эту запись предоставил Institut national de la recherche agronomique
