CAPÍTULO 1 = This study reports the isolation and molecular identification of yeasts isolated from water samples and bivalve molluscs (Mytella guyanensis and Crassostrea rhizophorae) commonly collected in the estuary of the river Subaé, São Francisco do Conde, Bahia. In addition to the central theme of isolation and identification of water yeast and the two above bivalve molluscs are discussed the implications to health and the environment, since the basin Subaé Rio suffers anthropic action, at some points, contemplating the estuarine environment, becoming an important factor for environmental monitoring. The isolates were identified in the study of the domains D1 / D2 gene ribosomal RNA (rRNA) 26S and, for some samples was conducted further study of RNA polymerase II gene region elucidating the identification to the species level. Additionally phylogenetic analysis of five species were carried out, which had not been previously reported in bivalve molluscs. 70 isolates were identified in yeast, distributed in nine genera, and Candida spp. and Rhodotorula spp. the prevalent genres. The study also revealed predominance of Filo Ascomycota with 48 representatives across the Basidiomycota with 17 isolates. Candida haemulonii, Candida maris, Candida infanticola, Candida natalensis, Hanseniaspora opuntiae had their first reported presence bivalve mollusks. This is the first report related to the molecular analysis of the yeast community in bivalve molluscs in northeastern Brazil. This study extends the knowledge of the diversity of bivalves associated with yeasts that are widely consumed form of raw or lightly cooked, can act as a further indicator of the quality of these fish. | CAPÍTULO 1 = O presente estudo reporta ao isolamento e identificação molecular de leveduras isoladas de amostras de água e de moluscos bivalves (Mytella guyanensis e Crassostrea rhizophorae) comumente coletados no estuário do rio Subaé, São Francisco do Conde-BA. Além do tema central de isolamento e identificação de leveduras de água e dos dois moluscos bivalves supramencionados, são discutidas às implicações a saúde e meio ambiente, uma vez que a Bacia do Rio Subaé sofre ação antrópica, em alguns pontos, contemplando o ambiente estuarino, tornando-se um fator relevante para o monitoramento ambiental. Os isolados foram identificados pelo estudo dos domínios D1/D2 do gene do RNA ribossômico (rRNA) 26S e, para algumas amostras foi realizado o estudo adicional da região do gene da RNA polimerase II elucidando a identificação a nível de espécie. Adicionalmente foram realizadas análises filogenética de 5 espécies, que não haviam sido relatadas anteriormente em moluscos bivalves. Foram identificados 70 isolados de leveduras, distribuídos em nove gêneros, sendo Candida spp. e Rhodotorula spp. os gêneros prevalentes. As análises também revelaram predominância do Filo Ascomycota com 48 representantes, frente ao Basidiomycota com 17 isolados. Candida haemulonii, Candida maris, Candida infanticola, Candida natalensis, Hanseniaspora opuntiae tiveram sua presença relatada pela primeira vez em moluscos bivalves. Este é o primeiro relato relacionado às análises moleculares da comunidade de leveduras em moluscos bivalves no Nordeste brasileiro. O presente trabalho amplia o conhecimento da diversidade de leveduras associada a bivalves que são amplamente consumidos de forma in natura ou levemente cozidos, podendo agir como mais um indicador da qualidade desses pescados. CAPÍTULO 2 = O objetivo desse trabalho foi identificar espécies de leveduras isoladas de moluscos bivalves in natura, principalmente as que apresentam patogenicidade ao homem. As leveduras foram isoladas de duas espécies de moluscos bivalves: sururu (Mytella guyanensis) e ostra (Crassostrea rhizophorae). A identificação ocorreu a partir do sequenciamento dos domínios D1/D2 e da construção de árvores filogenéticas com as sequências obtidas. Foram obtidos 9 isolados, os quais foram identificados em cinco espécies de leveduras, sendo que quatro pertencem ao gênero Candida e cinco pertencem ao gênero Hanseniaspora, o qual foi o único a ser encontrado nos dois moluscos. Este é o primeiro relato das espécies citadas nesse comunicado para isolamento em moluscos bivalves. Duas das espécies encontradas foram consideradas patogênicas ao homem em diferentes estudos, apresentando caráter de multirresistência a antifúngicos.

Dissertação de mestrado, Sistemas Marinhos e Costeiros, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2016 | Os estuários representam sistemas de transição entre os ambientes de água doce e marinhos. Estes proporcionam importantes habitats para a vida aquática e de proteção para muitas espécies. No entanto, são também sistemas muito afetados por pressão antropogénica. O Arade, é o segundo principal rio da costa algarvia, a sua zona estuarina é de grande importância, mas deficitariamente estudada do ponto de vista físico-químico, o que motivou a realização desta tese de mestrado. Os seus principais objetivos foram: 1) Estudar a variabilidade de vários parâmetros físico-químicos do baixo estuário, em função dum gradiente espacial e das diferentes estações do ano, em função da maré, e vertical e horizontalmente, ao longo de uma secção; 2) calcular as razões entre os nutrientes e entre clorofila a e feopigmentos; 3) estimar as concentrações dos nutrientes no rio Arade; 4) avaliar o estado trófico do baixo estuário do Arade, aplicando o índice Trófico TRIX; e 5) calcular o transporte de massa de água, nutrientes, sólidos em suspensão e oxigénio dissolvido. Os resultados mostram uma forte variabilidade espacial ao longo do estuário e ao longo do ano. Dos processos analisados, a mistura de massas de água do rio e do mar foi o mais importante para explicar esta variabilidade. As concentrações dos nutrientes aumentaram para montante, devido à maior contribuição de água doce. No entanto, os dados também revelam que na área de estudo, existiam fontes externas de nutrientes. Quanto ao estado trófico o estuário a qualidade da água mostrou-se Muito Boa a Moderada, com alguns locais mais problemáticos a montante. Sazonalmente, os valores mais elevados foram encontrados na campanha de inverno, por influência de drenagem e escorrência após um período de precipitação forte em oposição à situação de outono. Quanto aos transportes houve exportação de água, amónia, fosfatos, silicatos e SS e importação de nitratos e oxigénio.