Metabolomic characterization of 5 native Peruvian chili peppers (Capsicum spp.) as a tool for species discrimination
2022
Espichán, Fabio | Rojas, Rosario | Quispe, Fredy | Cabanac, Guillaume | Marti, Guillaume | Universidad Peruana Cayetano Heredia - Peruvian University Cayetano Heredia [Lima, Peru] (UPCH) | Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA) | Recherche d’Information et Synthèse d’Information (IRIT-IRIS) ; Institut de recherche en informatique de Toulouse (IRIT) ; Université Toulouse Capitole (UT Capitole) ; Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J) ; Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI) ; 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Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse) | FONDECYT-CONCYTEC under contract 134-2015-FONDECYT | ANR-11-LABX-0066,SMS/SSW,Structurations des mondes sociaux(2011)
International audience
显示更多 [+] 显示较少 [-]英语. Many species of chili peppers have overlapping morphological characters and delimitation by visual descriptors in many cases fails to differentiate one species from another. In Peru, there are 413 accessions of native chili pepper and 296 accessions of rocotos conserved in the Germplasm Collections of the National Institute of Agrarian Innovation (INIA), of which five accessions (three species from three locations) were selected for the present metabolomic study. The Discrimination of the three species of native chili peppers and identification of biomarkers was performed using untargeted metabolomic approach based on profiling by UHPLC-HRMS and multivariate data analysis. The samples of fresh chili peppers (whole fruit) from Chincha area were used to construct an OPLS-DA model. To validate the biomarkers (identified 15 biomarkers, mainly flavonoids), an external validation set of the OPLS-DA model was constructed using Chiclayo and Huaral collection datasets. Consequently, the OPLS-DA based on Chincha samples model has a high predictive capacity demonstrating that the biomarkers have a high probability of continuity in any culture space, being successful in discriminating the species by untargeted metabolomics.
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